石船神社は、『延喜式』の磐舟［いわふね］郡八座の筆頭に記されている、歴史のある神社です。

祭神は、饒速日命［にぎはやひのみこと］・みずはのめのみこと［みづはのめのみこと］・高おかみの神［たかおかみのかみ］・暗おかみの神［くらおかみのかみ］の四神です。饒速日命は物部氏の祖先神です。この神様は、高天原から天の石船［あめのいわふね］でお越しになった神様で、岩船の地名の由来となっております。また、罔象女命［みずはのめのみこと］以下三柱の神様は貴船神社の神々です。この貴船神社は、807年に秋篠朝臣安人［あきしのあそんやすひと］が社殿を建立し、京都の貴布禰明神を勧請されたと伝えられています。そのため、石船神社は「明神様」とも称されています。

社殿は明治29（1896）年に焼失しましたが、明治32（1899）年に再建されました。